Ciao,
l'unico modo è modificare il progetto generato, poichè il progetto di stile WRDefault non è modificabile.
Quindi puoi andare all'interno del progetto generato e cercare la cartella wr-images dove trovi il logo attuale. E' sufficiente copiare in questa cartella il tuo logo e rinominarlo con lo stesso nome del logo originale.
Attenzione però, perchè tutte le volte che rigeneri, il logo viene sostituito con l'originale di WebRatio. La strada migliore è quella di creare un nuovo progetto di stile ed applicarlo al progetto web.
Puoi far riferimento a questo articolo
Getting started with the Style Project